マックス殺害事件の黒幕であり、マイケルを解雇させた裏組織の最後の大物の正体が判明する。

マイケルはピアースの信頼を取り戻し、無事、CIAの機密取扱資格を手に入れたが…。

CIAの監視があるマイケルは動けず、ジェシーとフィオナを現地に向かわせる。

マイケルとフィオナは無線を傍受して、アンソンの電話相手がマデリンのボーイフレンド、ベニーだと突き止める。

驚くべきことにアンソンはマイケルの父の死にも関与していた。マイケルとフィオナは…。

アンソンの目的はマイケルを解雇させた組織の復活。マイケルは彼に計画を断念するよう説得を試みるが…。

グリー部員たちの関係も夏の間に大きく変化し、ウィルはバラバラになった部員たちをまとめようと奮闘する。

ウィルは全国大会を目指しダンスの猛特訓を始める。そんな彼らの前にボーカル・アドレナリンの元コーチ、シェルビーが現れる。

いつもレイチェルの陰になってしまうことに不満を募らせていたメルセデスは、とうとう我慢できずにグリー部を辞めてしまう。

議員に立候補していたスーの芸術予算削減案のせいでミュージカル上演がピンチに。それを救ったのはカートの父バートだった。

『ウエスト・サイド物語』の監督になったアーティから、経験もないのに“性の目覚め”が演じられるのかと言われ、動揺するレイチェルとブレイン。

ニュー・ディレクションズとトラブルトーンズの対立は深まるばかり。ウィルとシェルビーはマッシュオフ対決を提案する。

思いがけない形で秘密が暴露されてしまったサンタナ。彼女を励ますためにフィンは女性の曲を歌おうとメンバーに提案する。

パックとシェルビーの関係に気付いたクインは、それをネタに娘を取り戻そうと考えるが、レイチェルからみんなが傷つくと諭される。

クリスマスが迫り、スーからホームレス施設で歌って欲しいと頼まれた部員たち。地元テレビ局からも出演をオファーされ…。

ウィルとの関係に悩むエマは、スーやビーストに励まされ、思わず結婚してと彼に言ってしまう。ウィルは…。

ウィルは、地区大会でマイケル・ジャクソンの曲を歌えなかったメルセデスたちのために、州大会でもマイケルの曲を歌う事に決める。

歴史教師が退職し、終身在職権に空きが出たと知ったウィルは、エマとの将来のためにもなんとか在職権を手に入れようと奮闘。

婚約したレイチェルとフィンを止めるため、レイチェルの父親たちはある作戦を思いつく。

州大会が近づく中、セバスチャンに呼び出されたレイチェルは、大会に出場すればフィンの合成ヌード写真をネットにばら撒くと脅迫される。

レイチェルとフィンの結婚式に向かう途中で事故に遭ったクインは、脊髄を損傷し車椅子生活になっていた。

相変わらずディスコ・ミュージックに思い入れのあるウィルに対し、部員たちはディスコはダサいと反発。そんな中…。

ニューヨーク行きに夢膨らむカートに対しそっけない態度のブレイン。なんとなく距離を感じ始めた矢先…。

ビーストの顔にあるアザを見てからかうサンタナたちの言葉を聞いたスーは、女性の強さを歌った曲を課題に出す。

プロムが近づき学校内もわくわくムード。生徒会長のブリトニーの発案でテーマが恐竜に決定する。

いよいよ全国大会が目前に迫る中、相変わらずレイチェルがソロを歌うことに飽き飽きしていたティナ。そんな中…。

全国大会の地、シカゴにやってきたニュー・ディレクションズ。だがメルセデスが食あたりでダウンしてしまう。

ウィルはあと数日で卒業するメンバーのために、別れの曲を課題として出す。それぞれの想いを歌に込めるメンバーたち。そして…。

交際宣言した雨江（ユージャン）と明瓊（ミンチョン）。だが裏には黎（リー）総経理の圧力が…。

雨江と雅音を一緒にさせたい袁浩天は、明瓊（ミンチョン）と雨江の交際をやめさせようとする。